Ух, какие "съемные страсти"
Я правильно понял, сначала альгинат для инд ложки, потом этой ложкой силикон для второй ложки и уже по ней рабочая модель для съемника? 
Ну.. как бы, понты дороже денег.. но нафига это все, тем более по вашим же словам (ну и по фоткам), лажа выходит
Я вообще за альгинат, так как доктора, с которыми я работаю, к этому пришли уже давно. Можно, конечно, декомпрессионый оттиск снимать и силиконом, но докторам лень возиться и дороже альгината выходит, надо много коррегирующей использовать.
Толщина воска под ложку... так как обычно их делаю  под альгинат (это обычно 1 на штук 20 протезов ), то 1-2 обычных базисных пластинки. Есть док, который просил несколько раз под силикон (не было возможности сразу отливать, где то на выезде снимал) то тоже просил мин 1 мм зазор сделать.  И оттиски получились отличные, и съемники тоже
По фоткам видно не очень, но границы расширены, на нч возле бугров точно, и тяжики надо освобождать. тут даже для протеза они расширены, а для ложки должны быть заужены относительно протеза.
А протез варите на гипсе 4 класса? я уже гдето приводил свои мысли, почему это неправильно.
Ну и садить протез на модель, что бы проверить границы ...    вообще не представляю как это. у меня, редко когда модель остается целой. Я границы не проверяю, просто перед паковкой в кювету нацарапываю границы острым шпатылем и все, после варки все четко видно, до этой линии и пилю.